在感染性心内膜炎(心脏瓣膜感染)的诊断中，血培养是必需的。对于这个疑难疾病，细菌或真菌有机会从心脏瓣膜上脱落进入血流，所以发热期间要反复采血培养。对于感染性心内膜炎的患者说，如果采用最佳的培养条件，血培养的阳性率将超过90%。
1.急性感染性心内膜炎
疾病爆发后在几天到几周内快速进展，这可能是有高毒性的病原体所导致的，像金黄葡萄球菌。一旦怀疑，需要立即进行血培养，以免延误治疗。在经验性抗菌药物治疗前30分钟就应该取多对血样培养。
2.亚急性感染性心内膜炎
如果怀疑亚急性感染性心内膜炎，通常不要急于从开始就经验性治疗。尝试进行微生物诊断更为重要。在抗菌药物治疗开始之前，应该取多对血样培养。各组采血间隔为30分钟到1个小时。这有助于证明一个连续的菌血症，具有附加临床价值。
3.真菌性感染性心内膜炎
以往很少发生，但现在真菌性心内膜炎的发病率越来越多见。念珠菌是导致感染性心内膜炎的最常见的真菌病原体。如果样本采集条件合适，念珠菌导致的真菌性心内膜炎血培养阳性率达到83%-95%。
需要培养多少次呢？
为了辨别污染和真的菌血症，应做3到5对血培养。即从怀疑有感染性心内膜炎的患者取三组血样培养。如果经24小时培养后，第一次三组结果是阴性，再收集2组血培养，一共是5组血培养。在采血前，通常怀疑有感染性心内膜炎的患者已经进行经验性抗菌药物治疗，这是感染性心内膜炎“血培养阴性”的最常见原因。因此，在有抗菌药物存在的情况下，用有能力维持细菌生长的血培养基是很重要的。然而，“血培养阴性”心内膜炎也可能归咎于苛养菌，像曲霉菌，布鲁杆菌属，立克次体，衣原体和HACEK微生物。因为当前的血培养连续监测系统能够在五天内发现所有HACEK和其他的苛养菌，延长培养时间不再认为是有必要的。然而如果五天后，所有的血培养瓶都是阴性的，仍然怀疑感染性心内膜炎，应将瓶子的培养
物传到巧克力琼脂上培养。连续血培养监测系统为血标本处理提供了最佳解决方案。一般的孵育时间为5-7天，最常规的时间为5天。98%的阳性结果可在前3天内获得结果。

康都临床检验所微生物实验室可以为临床医生提供有帮助的信息，判断血培养结果是真阳性还是假阳性(污染)。例如，鉴定分离微生物可帮助判断是否污染，多个阳性培养的微生物鉴定可以帮助确认感染。